Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPV4Q9HBA0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPV4Q9HBA0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms