Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8P0

SRD5A3, Polyprenol reductase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRD5A3Q9H8P0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRD5A3Q9H8P0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRD5A3Q9H8P0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms