Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRDE2Q9H7Z3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRDE2Q9H7Z3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms