Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7P6

MVB12B, Multivesicular body subunit 12B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12BQ9H7P6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MVB12BQ9H7P6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVB12BQ9H7P6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVB12BQ9H7P6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms