Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPF2Q9H7B2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms