Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF1DQ9H5J8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF1DQ9H5J8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF1DQ9H5J8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms