Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMX4Q9H1E5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX4Q9H1E5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMX4Q9H1E5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMX4Q9H1E5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms