Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC8Q9H0W5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC8Q9H0W5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms