Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TM6SF1Q9BZW5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TM6SF1Q9BZW5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM6SF1Q9BZW5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms