Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM54Q9BYV2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM54Q9BYV2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms