Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf50Q9BV19 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms