Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKNK1Q9BUB5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKNK1Q9BUB5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MKNK1Q9BUB5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms