Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms