Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF8Q9BRL6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF8Q9BRL6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms