Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SDF4Q9BRK5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms