Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM7Q9BQ49 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms