Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOL4Q9BPW4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOL4Q9BPW4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms