Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH3GL2Q99962 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3GL2Q99962 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL2Q99962 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms