Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CMKLR1Q99788 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMKLR1Q99788 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms