Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC6Q99741 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC6Q99741 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC6Q99741 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC6Q99741 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms