Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF6Q99612 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF6Q99612 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF6Q99612 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF6Q99612 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF6Q99612 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF6Q99612 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF6Q99612 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLF6Q99612 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF6Q99612 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms