Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POP1Q99575 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POP1Q99575 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POP1Q99575 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POP1Q99575 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POP1Q99575 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POP1Q99575 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POP1Q99575 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POP1Q99575 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POP1Q99575 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POP1Q99575 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POP1Q99575 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POP1Q99575 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POP1Q99575 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POP1Q99575 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POP1Q99575 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POP1Q99575 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POP1Q99575 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POP1Q99575 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POP1Q99575 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POP1Q99575 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POP1Q99575 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POP1Q99575 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POP1Q99575 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POP1Q99575 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POP1Q99575 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
POP1Q99575 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POP1Q99575 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POP1Q99575 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POP1Q99575 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POP1Q99575 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POP1Q99575 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POP1Q99575 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POP1Q99575 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POP1Q99575 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POP1Q99575 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POP1Q99575 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POP1Q99575 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POP1Q99575 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POP1Q99575 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POP1Q99575 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POP1Q99575 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POP1Q99575 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POP1Q99575 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POP1Q99575 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POP1Q99575 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POP1Q99575 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POP1Q99575 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POP1Q99575 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POP1Q99575 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POP1Q99575 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POP1Q99575 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POP1Q99575 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POP1Q99575 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POP1Q99575 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POP1Q99575 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP1Q99575 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP1Q99575 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP1Q99575 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP1Q99575 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP1Q99575 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP1Q99575 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP1Q99575 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POP1Q99575 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POP1Q99575 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POP1Q99575 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POP1Q99575 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POP1Q99575 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POP1Q99575 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POP1Q99575 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POP1Q99575 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POP1Q99575 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POP1Q99575 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POP1Q99575 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POP1Q99575 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POP1Q99575 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POP1Q99575 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POP1Q99575 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POP1Q99575 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POP1Q99575 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POP1Q99575 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POP1Q99575 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POP1Q99575 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POP1Q99575 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms