Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGMNQ99538 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGMNQ99538 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms