Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAT1Q99536 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms