Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHOX2BQ99453 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHOX2BQ99453 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHOX2BQ99453 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHOX2BQ99453 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms