Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK5RAP2Q96SN8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK5RAP2Q96SN8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK5RAP2Q96SN8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms