Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ6

FERD3L, Fer3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERD3LQ96RJ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FERD3LQ96RJ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FERD3LQ96RJ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms