Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSDMAQ96QA5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSDMAQ96QA5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSDMAQ96QA5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms