Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UHRF2Q96PU4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms