Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGLYRP2Q96PD5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGLYRP2Q96PD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGLYRP2Q96PD5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms