Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00167Q96N53 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms