Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU6

ZNF778, Zinc finger protein 778, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF778Q96MU6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF778Q96MU6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF778Q96MU6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF778Q96MU6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms