Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC114Q96M63 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC114Q96M63 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms