Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC17Q96LX7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC17Q96LX7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC17Q96LX7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms