Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
KCNH8Q96L42 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
KCNH8Q96L42 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
KCNH8Q96L42 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
KCNH8Q96L42 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
KCNH8Q96L42 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KCNH8Q96L42 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms