Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPZA3Q96KX2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPZA3Q96KX2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms