Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MS4A4AQ96JQ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MS4A4AQ96JQ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A4AQ96JQ5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms