Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMX3Q96JJ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMX3Q96JJ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMX3Q96JJ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms