Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEC22AQ96IW7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC22AQ96IW7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms