Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM46AQ96IP4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM46AQ96IP4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
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