Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A3Q96HJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A3Q96HJ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MS4A3Q96HJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms