Protein–RNA interactions for Protein: Q96HG1

SMIM10, Small integral membrane protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10Q96HG1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM10Q96HG1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM10Q96HG1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms