Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN17Q96FV3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms