Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC10A4Q96EP9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC10A4Q96EP9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC10A4Q96EP9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms