Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L3HYPDHQ96EM0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L3HYPDHQ96EM0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms