Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SHISA4Q96DD7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHISA4Q96DD7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms