Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC39Q96DD0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC39Q96DD0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms