Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF653Q96CK0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF653Q96CK0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms