Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTHRC1Q96CG8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTHRC1Q96CG8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTHRC1Q96CG8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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