Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPCDCQ96CD2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPCDCQ96CD2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCDCQ96CD2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCDCQ96CD2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCDCQ96CD2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCDCQ96CD2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCDCQ96CD2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCDCQ96CD2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCDCQ96CD2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCDCQ96CD2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCDCQ96CD2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCDCQ96CD2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCDCQ96CD2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms